北京市轨道交通指挥中心主要承担本市轨道交通线网运营协调以及应急处置工作，承担轨道交通线网运营信息汇总和统计分析，组织拟订售检票系统的技术标准、管理规范和业务规则，研究提出有关票制、票价调整意见等工作。
